縱差保護主要是用來反應變壓器繞組及其他套管、引出線上的相間短路，同時也可以反應變壓器繞組匝間短路及中性點直接接地系統側繞組、套管、引出線的單相接地短路。而差動保護主要用來保護雙繞組或三相繞組變壓器的繞組內部及其引出線上發生的各種相間短路故障，同時也可以用來保護變壓器單相匝間短路故障。
縱聯差動保護與橫差保護的區別
1、縱聯差動保護與橫差保護是否具有選擇性
縱聯保護，是將兩端的電氣量比較，以判斷故障在本線路范圍內還是在線路范圍外，從而決定是否切斷被保護線路。因此，理論上這種縱聯保護具有絕對的選擇性。而橫差保護沒有。
2、縱聯差動保護與橫差保護地點不同
橫聯差動方向保護反應的是平行線路的內部故障，而不反應平行線路的外部故障。 而縱聯差不少是。
3、縱聯差動保護與橫差保護的使用范圍不同
發電機縱連差動保護的范圍是發電機定子線圈相間短路的主保護，所有發電機都必須安裝此保護。而發電機橫差保護只有在發電機繞組為雙星形或多星形接線時才會采用。
4、在阻抗相同的兩條平行線路上可裝設橫聯差動方向保護。橫聯差動方向保護反應的是平行線路的內部故障，而不反應平行線路的外部故障。
5、縱聯差動保護安裝于變壓器的高低、壓側（或組合繼電器的線分別接高、低壓側的保護CT回路），根據輸入、輸出功率相等原理（要修正空載損失），監測變壓器運行狀況。一旦兩側被監測數據異常達到整定值，即保護裝置即動作開關，將變壓器從系統切除。橫差保護不是。
