我國于1999年1月1日施行的《土地管理法》提出“一戶一宅”的法律規定，根據法不溯及既往原則，在1999年1月1日之前建造的房屋，是不受“一戶一宅”法律規定的限制，也就是1999年1月1日之前出現在農村的“一戶多宅”問題，屬于歷史遺留問題，可以依法獲得宅基地確權。但是在1999年1月1日及以后，“一戶多宅”多出來的宅基地是不能依法確權的。
那么，1999年1月1日及以后，農村出現的“一戶多宅”問題，應該怎么辦呢？
第一個辦法：自愿“有償”退出多余宅基地。
國家關于宅基地制度改革舉措中提出，對于合法存在的一戶多宅情況，在農村居民自愿的前提下，可以選擇退出多余的宅基地，并且能夠依法獲得一筆退出補償金，具體金額以當地政策補償標準為主。
合法存在的一戶多宅情況指的是：農民分戶多出的宅基地、所有宅基地面積總和不超過當地限制面積的宅基地、繼承父母的宅基地、戶口回遷多申請的宅基地、村集體內部合法交易和轉讓獲取的宅基地。
除此之外，對于非法獲取的一戶多宅的情況，比如以強制和欺騙手段占有的多余宅基地，既不能確權，也無法享受有償退出的政策，還會被責令限期拆除。
第二個辦法：在村集體經濟組織成員之間進行流轉。
農村居民并不享有農村宅基地的所有權，只是享有使用權。面對一戶多宅的情況，多余的宅基地不能進行確權，所以多余宅基地上所建的房屋不能進行翻蓋、加蓋等建設行為，未來評估為危房的時候，村集體經濟組織有權收回危房所屬的宅基地。
與其如此，一戶多宅的前提下，不如把多余的宅基地，流轉（有償出讓）給村集體中需要宅基地的經濟組織成員，既能獲取收益，又能滿足他人對宅基地的需求，還減少了農村土地自愿的浪費。
第三個辦法：通過繳費的方式繼續有償使用。
“一戶多宅”的情況是不符合我國《土地管理法》的相關規定的（歷史遺留問題除外），所以很多地區農村已經推出了有償使用多余宅基地的政策，根據當地宅基地規劃建設的面積標準，對超出限制標準的面積和多余的宅基地進行“按平方米收費”的方式征收費用，也就是農村宅基地有償使用制度。
所以一戶多宅的情況下，農村居民可以通過繳費的方式，繼續行使對多余宅基地的使用權。
總結：農村“一戶多宅”的問題，背后的原因是非常復雜的，但是一戶多宅不等于就一定是違法建筑，對于合法存在的一戶多宅問題，既不會被責令限期拆除，也不會被強制收回村集體經濟組織。農村居民（一戶多宅的個人）可以通過自愿有償退出、村集體內流轉和自行繳費的方式，對多出來的宅基地行使合法的使用權。
