第一種是浸泡法。所謂浸泡法就是把一種含氯的泡騰片經水分解后，注入飲水機加熱內膽中，浸泡20分鐘左右。最后用清水反復沖洗內膽，直至干凈為止。此種方法可有效清除殺滅大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、白色念珠菌、枯黃桿菌黑色變種芽孢。但是因含氯產品有很大的刺激性味道，機內附著物吸收后很難沖凈，直接影響水的口感，而且會對機器零部件產生腐蝕，從而影響飲水機壽命。這種消毒方式優勢在于價格低廉，操作簡便;劣勢在于清洗效果不好，藥物殘留較嚴重。使用該藥物進行消毒是目前最為常見的。
第二種方法是熏蒸法。該方法是利用臭氧的殺菌作用來達到清洗水機的作用。將臭氧從飲水機上部的入水口注入，大約經過20分鐘的熏蒸可以殺滅大部分的有害細菌，此方法消毒效果很好，且成本較低，但沒有清洗水垢等雜質作用。消毒過程中，揮發出的臭氧對人體也有不利的影響。
第三種方法是加壓過濾法。據北京藍色境界的清洗公司負責人介紹該方法是利用一種專業清洗機械來進行清洗。將清洗機的一端接到水機的入水口，另一端接入飲水機下部的排水口，形成一個閉環循環，采用環保的過氧化氫消毒劑作為介質。該方法利用清洗機械自身的循環壓力，不但可以充分達到清洗目的，然后通過機械壓力可以將被清洗出來的水垢和雜質完全排出。該方法因采用的是過氧化氫清洗劑，經化學反應后生成物為水和氧氣，對人無毒無害。
清洗飲水機的方法
1、浸泡消毒法。它是利用消毒液浸泡飲水機的各個管路，消毒液有效成分以二氧化氯、雙氧水為代表：二氧化氯成本低，但殘留不易清洗;雙氧水的殘留易清洗，但價格高。
使用二氧化氯消毒時，用50～100mg/L濃度的溶液浸泡5分鐘，即可達到消毒目的;使用雙氧水消毒時，浸泡時間同為5分鐘，但濃度為1.5%。另外，甲醛、二醛等醛類消毒劑盡管殺菌能力很強，但刺激性氣味大，而且無法對飲水機的內膽、管壁、分水管道等部位進行循環沖洗，難以將污物帶出，因此不向大家推薦。
2、噴淋循環消毒法。它是利用“高壓噴淋”的工業消毒原理，從飲水機進水口噴射消毒劑，通過高壓使消毒水流在飲水機“體內循環”，藥液回收后無須再用水洗，費用與浸泡消毒法相當，已受到許多飲水機生產廠商的關注。
3、釋放臭氧消毒法。在飲水機冷水腔和熱水腔內的剩水放完的情況下，將消毒插頭插在飲水機進水口處，接入臭氧發生器的膠管，打開臭氧發生器電源，通入臭氧15分鐘。然后，打開冷水嘴，用臭氧對冷水流通管道消毒，5分鐘后關閉冷水嘴，再打開熱水嘴對熱水管道進行消毒。
清洗飲水機的步驟
1、去電源插頭，取下水桶，打開飲水機后面的排污管口(一般為白色塑料材質的旋鈕)，排凈余水。然后，再打開冷熱水開關放水。
2、取下“聰明座”(就是飲水機內接觸泉水桶的部分)，用酒精棉仔細擦洗飲水機內膽和蓋子的內外側，為下一步消毒做準備。
3、按照去污泡騰片或消毒劑的說明書配置消毒水(去污泡騰片和專用消毒劑超市都有賣，價格也不貴)，導入飲水機，使消毒水充盈整個腔體，留置10~15分鐘。
4、打開飲水機的所有開關，包括排污管和飲水開關，排凈消毒液。
5、用清水連續沖洗飲水機整個腔體(這個過程建議把飲水機搬到衛生間里，保證水量充沛)，打開所有開關排凈沖洗液體。
正確清洗飲水機七妙招
誤區一：拔去電源插頭，取下水桶，打開飲水開關，放出飲水機腔內的剩余水。
專家評析：對飲水機進行消毒的第一步的確是放出飲水機腔內所有的剩余水，但是我們打開飲水機的龍頭時，只能放出一小部分的水，所以這種消毒方法存在著很大的不足。
正確的做法是：先打開飲水機后面的排污管，排凈余水，因為排污管里的剩余水才是導致飲水機二次污染的關鍵，然后再打開所有飲水開關，放出殘余水。
誤區二：往飲水機內膽倒入300毫升多功能消毒劑，浸泡10～15分鐘。專家評析：飲水機腔體的容量為2升左右，區區300毫升消毒劑，只能消毒極其有限的飲水機內腔空間，這樣的消毒是無效的。
正確的做法是：將300毫升消毒劑溶解到2升左右的水里，使其充盈整個腔體，留置10～15分鐘。
誤區三：用鑷子夾住酒精棉球，擦洗飲水機內膽。
專家評析：飲水機蓋子的內外側直接與空氣接觸，很容易積聚細菌，因而也要去除上面的污垢才行。可先用酒精擦洗其表面，為下一步消毒做準備。
誤區四：打開飲水機開關，排凈消毒液。
專家評析：如上所述，飲水機開關只能放出一部分消毒液，還有部分消毒液仍滯留在腔體內，如不排盡，它將成為新的水質污染源。
正確的做法是：打開飲水機的所有開關，包括排污管和飲水開關，以排凈消毒液。誤區五：用1000毫升清水沖洗整個飲水機腔體，然后打開飲水機的所有開關放水。
專家評析：用1000毫升清水沖洗飲水機內膽是遠遠不夠的，這會導致消毒液殘留在飲水機內。
正確的做法是：用7～8升清水連續沖洗飲水機整個腔體，并打開所有開關排凈沖洗液體。
誤區六：用抹布擦洗飲水機開關處的后壁。
專家評析：當用杯子盛水時，很容易碰到飲水機開關處的后壁，所以此處不能只作簡單的去污處理。
正確的做法是：用酒精棉球擦洗開關處的后壁。
誤區七：飲水機消毒完畢，放上桶裝水后，馬上放水飲用。
專家評析：飲水機消毒完畢后，還可能有微量的消毒液殘留，不能馬上放水飲用。
正確的做法是：放出一杯水，聞聞有沒有氯的氣味。如有，就應再放水，一直放到水中聞不出氯氣味時，才可以放心飲用。
