不是直接扣公積金。一般申請住房公積金貸款之后，是需要給銀行提供還款賬戶的，銀行會從提供的還款賬戶里來扣款，而不是從公積金賬戶扣款，如果是辦理了公積金對沖業務，那么在扣款時是會先扣住房公積金賬戶中余額的。
公積金貸款買房是什么意思？
指由住房公積金管理中心運用住房公積金，委托銀行向購買、建造、大修自住住房的住房公積金繳存人和在職期間繳存住房公積金的離退休職工發放的貸款。繳存人在貸款時必須滿足幾個條件，首先貸款人要具備完全民事行為能力，其次要擁有穩定的職業和收入，有償還貸款本息的能力，最后要符合公積金貸款的條件和政策。
用住房公積金貸款買房有什么好處？
1、公積金貸款利率優惠
公積金貸款利率更低，具體多少，每個地區的利率都不一樣，總的來說住房公積金貸款利率比商業貸款基準利率低2個百分點左右，當然這只是大概的，具體多少要咨詢公積金管理中心。
2、公積金貸款還款更加靈活方便
公積金貸款買房，在還款方式上會更加的靈活，貸款人可以自己確定每月還款額，但前提是每個月的還款額不要低于銀行規定的較低還款額。這樣貸款人可以根據自己的經濟實力制定合理可行的還款計劃，方便貸款人安排自己每月的經濟支出。
3、公積金貸款對所購房屋的限制性更小
公積金貸款銀行對二手房房齡限制比較少，二手房的房齡和住房貸款年限加起來不會超過50年就可以申請公積金按揭貸款。
公積金貸款買房要注意什么？
1、住房公積金不可以直接用作買房支付首付，有很多人都會認為公積金能支付買房首付，其實并不是這樣，一般來講公積金都是先使用以后再進行提取，簡單說如果要用住房公積金貸款購房，首先要先墊付首款，然后再攜帶身份證或者是夫妻雙方身份證，戶口本等材料到當地住房公積金管理提取公積金余額才可以。
2、公積金提取金額不能超過房款總金額，而且有一部分人繳納住房公積金金額比較大，有些可能賬戶里有五十萬元，但是購房總金額為三十萬，所有想把公積金余額全部提出，支付完房款還能剩余二十萬，但是實際不是這樣，住房公積金提取總額不可以超過房款總額，就算公積金賬戶里有五十萬，但是購買房屋總金額不足五十萬，一樣不能全額提取。
3、公積金結清貸款以后可以再使用公積金買房，如果說已經申請過公積金貸款，那么公積金系統上都會有記錄，如果是貸款還沒有還清，或者是你的配偶無法再次辦理公積金貸款，但是，你已經結清了之前貸款，那么你就能再次申請公積金貸款買房，而且還不受二套房政策限定。
